Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDGFL1Q5TGJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms