Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM74A1Q5RGS3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM74A1Q5RGS3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms