Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms