Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms