Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47AQ5JRC9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms