Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms