Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms