Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP55Q53EZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms