Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms