Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms