Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCGF3Q3KNV8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms