Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF1Q3BBV0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms