Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms