Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTU2Q2VPK5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTU2Q2VPK5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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