Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCK2Q16822 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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