Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms