Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2Q16621 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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