Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms