Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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