Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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