Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLFQ16534 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLFQ16534 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLFQ16534 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLFQ16534 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLFQ16534 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLFQ16534 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLFQ16534 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms