Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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