Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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