Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SNCBQ16143 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SNCBQ16143 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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