Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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