Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED1Q15648 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED1Q15648 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED1Q15648 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED1Q15648 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED1Q15648 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED1Q15648 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED1Q15648 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED1Q15648 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED1Q15648 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms