Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHBQ15464 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHBQ15464 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHBQ15464 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHBQ15464 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHBQ15464 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHBQ15464 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHBQ15464 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHBQ15464 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHBQ15464 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHBQ15464 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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