Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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