Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPAQ15257 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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