Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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PDK3Q15120 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PDK3Q15120 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PDK3Q15120 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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