Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KARSQ15046 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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