Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms