Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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