Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IHHQ14623 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IHHQ14623 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IHHQ14623 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IHHQ14623 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms