Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIDRQ14159 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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