Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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