Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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