Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms