Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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