Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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