Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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