Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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