Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RESTQ13127 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RESTQ13127 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RESTQ13127 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RESTQ13127 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RESTQ13127 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RESTQ13127 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RESTQ13127 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RESTQ13127 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RESTQ13127 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RESTQ13127 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RESTQ13127 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RESTQ13127 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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