Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TRAF3Q13114 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TRAF3Q13114 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF3Q13114 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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