Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC16Q13042 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms