Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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