Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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