Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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