Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms