Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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